医学科学四处主要资助医学免疫学、人类生殖系统与胎儿、新生儿和围生医学领域的基础研究和应用基础研究。其中，医学免疫学主要资助针对免疫系统的形态、结构、功能及发育分化，免疫代谢与免疫老化，非经典免疫细胞、组织和器官的免疫学功能等开展的研究，以及针对各种疾病的免疫病理机制、免疫调节机制、免疫预防、免疫诊断、免疫治疗等开展的基础和应用基础研究。生殖系统、围生医学、新生儿主要资助人类生殖系统结构和功能异常及各种相关的非肿瘤性疾病研究，以及妊娠和妊娠相关性疾病、胎儿发育异常、新生儿疾病、辅助生殖、产前诊断、避孕与节育相关研究等。
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